A fisioterapia respiratória assume um papel essencial, tanto no tratamento como na prevenção. No tratamento, ajuda a mobilizar secreções, melhorar a ventilação pulmonar e diminuir o desconforto respiratório, reduzindo a necessidade de medicação ou até de internamentos. Já na prevenção, o impacto pode ser ainda maior: através do ensino de técnicas de higiene brônquica, da orientação aos pais sobre exercícios respiratórios simples e da promoção de hábitos que favorecem a saúde pulmonar. 

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Outro ponto fundamental é a ligação entre os diferentes sistemas. As estruturas cranianas, o trato digestivo e o sistema respiratório estão intimamente relacionados.